Mnoho studentů a absolventů ČAO se postupně zapojilo do různých druhů odbojové činnosti a byli terčem nacistické perzekuce. V řadách studentů Českoslovanské obchodní akademie byly do odbojové činnosti zapojeny i celé třídy. Bylo to aktem obrovské odvahy, jelikož se škola, kde v minulosti učil československý prezident Edvard Beneš, těšila zvláštní pozornosti německých úřadů. Do školy přišla mimo jiné z strany německých úřadů kontrola zakázaných knih. Profesoři se tehdy rozeběhli do svých tříd a vycházeli s napěchovanými aktovkami, do nichž žáci schovali knihy a tiskoviny, které byly v školách zakázané.Dalším akt vzdoru okupantům bylo organizování pomoci studentce, která byla postižena zkázou Lidic ze strany členek profesorského sboru. Pomoc byla zaslána do koncentračního tábora a když přišlo období maturit, byla její fotografie zařazena na veřejně vystavené maturitní tablo.Jsou známy případy studentů a pracovníků ČAO, kteří po okupaci utekli do exilu a přidali se k zahraničním jednotkám RAF nebo pomáhali v rámci Mezinárodního červeného kříže.